几何和晶格优化

本教程将教您如何:

  • 用Quantum eSpresso建立一个固体的几何形状(包括格子)的优化
  • 使用Amsmovie查看结果

第1步:开始amsinput

开始AmsInput.
切换到 量子浓咖啡: adfpanel. Quantumespressopanel.

如果您尚未安装Quantum eSpresso,则会弹出一个对话框,建议通过从SCM网站下载它来安装量子浓缩咖啡。 本教程工作是必需的。下载可能需要一段时间,因为它是一个大包。

../_images/qe-main.png

第2步:设置系统 - 硅

按CMD-F或CTRL-F激活搜索框 搜索
在搜索框中键入'si'
点击晶体列表中的“si”
点击 句号viewtool. 启用定期显示

正如我们想要展示格子优化的那样,我们将改变格子一点,所以会发生一些事情:

在主面板中单击 更多 右侧右侧右侧选项
将晶格向量中的所有非零值更改为3.0
../_images/lattice-edited.png

第3步:设置计算

首先设置所需的几何优化:

点击Main返回主面板
将任务切换为“GeometryOptimization”
点击 更多 按钮转到优化细节
检查“优化格子”复选框
../_images/optimize-lattice.png.
点击Main返回主面板

我们还需要设置一般计算选项。

对于本教程,我们将在其默认值留下大多数选项。 对于真实的实时应用程序,您当然必须检查您的结果是否会融合到K点网格和挥发性能量截止。

用户必须设置的一个选项是用于使用的伪软件。 遵循伪软件标题的三个选项作为过滤器:伪软盘目录中的所有伪势 可以显示系统中的元素。通过选择选项(相对性,XC和类型),缩小可用伪软件列表。

将鼠标移到伪软件类型菜单上,并检查气球中的信息
../_images/pptype-balloon.png
从XC菜单中选择“pbe”
从“类型”菜单中选择“van”
../_images/geometry-setup.png.

这只是一个例子,您需要确定自己(通过计算和/或文学),伪软通全是最适合您的工作。 我们在本教程中所做的选择绝不是关于使用哪种伪能源的建议。

第4步:运行你的工作

在当地机器上运行你的工作非常简单:

使用“文件”菜单中的“运行”命令: 文件→运行
在“保存文件”对话框中弹出将作业保存为“Silicon-Geometry”

你的工作应该开始运行。在AMSJobs窗口中,您可以遵循其进度,单击进度线以打开Amstail显示进度的完整详细信息。

当您的作业准备就绪时,AMSJOBS将显示此功能,并且AmsInput将提示您更新几何。 如果您单击“是”的几何(Atom坐标和晶格向量)将通过计算结果进行更新。 现在,您可以使用ADF套件(如乐队或DFTB)中的Quantum Espresso或其他程序继续对优化系统执行任何其他计算。

第5步:检查结果

在计算结束时,基于量子浓咖啡的结果自动创建RKF文件。 rkf文件由ADF套件的程序使用, 所以我们现在可以使用所有GUI模块来检查结果。

在本教程中,我们将使用Amsmovie查看几何优化:

在Amsjobs中,确保选择硅几何作业(通过单击它)
开始Amsmovie. SCM→电影
在Amsmovie:
显示能量图: 图表→能量
在Amsmovie中,显示格子的长度: 图表→格子矢量长度→矢量1
单击左侧的播放按钮
../_images/geometry-graph.png.