Amsprep:构建ADF Cosmo结果文件 一种¶

模块AMSPrep旨在促进脚本。 有关AMSPrep的更多详情可以在其中找到 脚本手册中的AMSPrep部分. 对于cosmo-rs,最相关的是adfcrs模板。 模板ADFCR将执行气相几何优化, 接下来,在气相优化几何体处计算COSMO计算。

在下一个示例中,ADF计算的结果是一个名为Adfwater.coskf的文件,它是一个ADF Cosmo结果文件,可以用作Cosmo-RS计算的输入,另见 示例:Cosmo-Rs教程1.

cat << eor > water.xyz
3

H       0.00000000       0.77121000       0.18071000
O       0.00000000      -0.00000000      -0.36142000
H       0.00000000      -0.77121000       0.18071000
eor

"$AMSBIN/amsprep" -t  adf. CRS -m water.xyz -j adfwater >job
chmod +x job
./job