脚本教程

pl

pl(用于自动化分子模拟的Python库)是一种用于为分子建模程序提供强大,灵活,易于扩展的Python接口的工具集合。 该库负责输入准备,作业执行,文件管理和输出处理以及构建更高级数据工作流程的帮助。

这些教程承担了一些熟悉

  • Python编程语言(版本3.6)
  • Unix命令行壳牌如bash
  • adf.AMS. 阿姆斯特丹造型套件的节目

在开始教程之前的重要说明

  • Make sure that the Amsterdam Modeling Suite is installed and that the adf.BIN environment variable is correctly set (adf.BIN should contain the path to the Amsterdam Modeling Suite bin directory). You can test this by typing $ADFBIN/plams -h in a terminal: this should print PLAMS’ help message. If this is not the case (e.g. No such file or directory), you need to set up the environmental variable $ADFBIN (see the Linux QuickStart指南 for details).
  • Plams是一个开源库,但为了运行教程的示例脚本,您需要计算引擎的许可证 adf.AMS.。接触 执照@SCM..com 有关其他问题。

教程