所有振动福彩3d字迷

随着振动分析,我们专注于分子振动的计算 福彩3d字迷及其相关性质。这些分子正常福彩3d字迷是 通常在谐波振荡模型内计算。

如果分子处于其平衡构象,则它位于最低点 (至少在本地)在PES上。 PES配置文件的横截面靠近 然后可以假设这一点是大约抛物线,使得 能量的第二导数W.R.T可以解释核坐标 作为原子谐振振荡的力常数 协调。由于聚原型中的分子振动涉及同时 该谐波振荡器模型的多个原子的位移可以是 概括到多个核坐标。正常福彩3d字迷及其 然后频率成为力常数的特征向量和特征等值 matrix, the Hessian:

\ [h_ {ij} = \ frac {\ partial ^ 2e} {\ partial {} r_i \ partial {} r_j} \]

这位奇怪的是可以要求作为一个 PES财产 in AMS.

Properties
   Hessian [True | False]
End
Properties
Hessian
类型:BOOL.
默认值:错误的
描述:是否或不是计算黑森州。

(非批量加权)Hessian保存在发动机结果文件中作为变量 AMS.Results%Hessian。它不打印到文本输出。列/行 指数被命令为:Atom 1,Atom 1的Y组件的X组件, 原子1,原子2的X组分等的Z组分。

最多 引擎 无法分析地计算黑森州。这 然后通过数值分化来构建众所周知的列 能量梯度w.r.t.每个核坐标。 AMS将成立2 单点计算(1用于正排量,1为负 位移),所请求的引擎将返回能量梯度 这些位移。这些梯度是为大多数分析计算的 engines.

笔记

全粗麻痹的数值计算需要6N单点计算, 这可能需要大量的大量时间。 福彩3d字迷选择性方法可以是快速替代方案。

您还可以请求AMS计算普通福彩3d字迷(及其属性)。 AMS将获得正常福彩3d字迷作为大规模加权的特征向量 Hessian.

Properties
   NormalModes [True | False]
End
Properties
NormalModes
类型:BOOL.
默认值:错误的
吉伊名称:频率
描述:计算振动的频率和正常福彩3d字迷,以及分子也相应的IR强度。

然后从黑森州获得正常福彩3d字迷的频率 特征值是振动福彩3d字迷的有效力量常数:

\ [\ nu = \ frac {1} {2 \ pi c} \ sqrt {\ frac {\ lambda} {\ mu_r}} \]

这里 \(\ nu \) 是振动频率 \(cm ^ { - 1} \), \(\ lambda \) 赫森特的特征值是 \(\ mu_r \) is the reduced mass 与振动福彩3d字迷相关联。

注意,正常福彩3d字迷还包括3个平移和3个旋转福彩3d字迷 (2用于线性分子)。其中,这些被称为“刚性福彩3d字迷”。 虽然它们不是作为振动光谱的一部分呈现,但它们仍然存在 stored in the 引擎结果文件 在 the Vibrations section.

当请求正常福彩3d字迷计算时,集成的IR强度是 在有限差分步骤期间同时计算 构建黑森州(只要偶极偶数支持 引擎)。这些IR强度由数值偶极子计算 gradients:

\ [i_ {ir} = \ frac {n \ pi} {3c ^ 2} \ sum_ \ alpha \ big(\ sum_j \ frac {\ partial {} \ mu_ \ alpha} {\ partial {} r_j ^ m} q_ {j} ^ m \ big)^ 2 \]

在哪里 \(\α\) 表示偶极矩的X-,Y和Z组件 \(\亩\), 和 \(q ^ m \) 是大量振动正常福彩3d字迷。

笔记

使用这种方法获得准确的结果,谐波近似 必须持有。因此,您的计算应在系统的均衡处完成 几何学。由于不同的发动机,功能,参数集等。所有 收益略有不同,建议始终在 用几何优化计算正常福彩3d字迷和/或Hessian 在所需的引擎设置。可以首先运行此优化 然后从a中获取黑森州/福彩3d字迷 PES点 计算,或通过使用该步骤将两个步骤组合成一个作业 几何学 optimization task together with the Properties%NormalModes keyword.

Older versions of ADF and BAND in AMS supported a ScanFreq keyword which 允许用户在正常后重新计算可疑/寄生频率 mode calculation. This keyword is now available as ScanModes under the NormalModes 输入块。它允许用户指定频率范围。 将重新计算具有此范围内的频率的所有正常福彩3d字迷。默认 这包括所有负频率和高达10厘米的正频率 \(^ { - 1} \). 数值差异化的步长使用该规定的 VibrationalAnalysis 块(默认为0.001)。

NormalModes
   FreqRange float_list
   ScanModes [True | False]
   UseSymmetry [True | False]
End
NormalModes
类型:堵塞
描述:配置正常福彩3d字迷计算的详细信息。
FreqRange
类型:浮动名单
默认值:[-10000000.0,10.0]
单元:cm-1
再次发生的:真的
描述:指定将扫描所有福彩3d字迷的频率范围。 (2个数字:上限和下限。)
ScanModes
类型:BOOL.
默认值:错误的
描述:在正常福彩3d字迷计算后是否扫描虚拟福彩3d字迷。
UseSymmetry
类型:BOOL.
默认值:真的
描述:是否利用系统在正常福彩3d字迷计算中的对称性。

An extension of this functionality is available as the ModeScanning application in AMS. For more details on how ScanModes recalculates frequencies and the extensions implemented by ModeScanning, see its 文档页面.