示例:nbo分析:adfnbo,gennbo

Download H2O_ADFNBO.run

Autschbach博士,SCM和Weinhold教授已经合作,为叫做Adfnbo的Put Put文件发生器进行了合作,为Weinholds自然债券轨道教授(NBO)6.0包装的Gennbo计划: http://nbo6.chem.wisc.edu Gennbo可执行文件包含在ADF分布中,并且可以通过许可证文件启用( 信息@SCM..com)。

用法:

$ADFBIN/adf <<eor
Title simple NBO example for water

Atoms    Z-Matrix
O   0 0 0
H   1 0 0   0.9
H   1 2 0   0.9  100
End

Basis
CORE NONE
TYPE DZ
End

FULLFOCK
AOMAT2FILE
SAVE TAPE15
SYMMETRY NOSYM

End Input
eor

$ADFBIN/adfnbo <<eor
write
fock
spherical
end input
eor

$ADFBIN/gennbo6 FILE47

注意添加了:推荐是使用密钥‘spherical’在ADFNBO输入中。

名为File47的文件由ADFnbo生成,它是NBO程序Gennbo一般的输入文件。 ADF需要将一些数据写入文件,该文件通过在ADF输入文件中包含这些关键字来完成:

FULLFOCK
AOMAT2FILE
SAVE TAPE15
SYMMETRY NOSYM

Gennbo.

接下来,给出了Gennbo能力的简要概述(由Weinhold教授)。 Gennbo如NBO网站所述实现全NBO 6.0计划套件的大多数功能: http://nbo6.chem.wisc.edu 这些包括测定天然原子轨道(NaOS),键轨道(NBO)和局部MOS(NLMOS),以及相关的NPA(原子电荷和轨道群)和NRT(共振结构,权重,键订单)价值描述符,对于各种不相关和相关(变分,扰动或密度函数)理论水平。 Gennbo支持的选项包括除了明确要求与主机电子结构系统(VIZ,$ DEL删除,NEDA,NCS,NJC)进行交互式通信的所有关键字。 Gennbo程序通常在PC桌面上方便地坐落在PC桌面上,准备分析(或默认分析,改变选项)在远程群集上执行的复杂ADF计算的最终结果。

Gennbo.“communicates”通过原始ADF通过存档文件(Job.47文件,保留最初由ADF生成的最终密度的所有必要细节),随后成为Gennbo的输入文件。 .47文件包含一个标准$ nbo ... $最终键词,可以用标准文字处理器或文本编辑器编辑,以包括所选择的nbo关键字选项,就好像它们可能已经出现在交互式adfnbo的原始输入流中跑步。因此,独立的Gennbo计划允许在休闲探索许多替代的NBO分析选项,而无需昂贵地重新计算波函数。

使用Gennbo可执行文件只有在SCM的许可证文件中启用NBO6( 信息@SCM..com)。在这种情况下,您将以电子形式访问NBO 6.0手册,详细解释了Gennbo如何使用Gennbo以及如何解释输出。