Cosmo-Rs.复合数据库

adf.有一个Cosmo结果文件的数据库, Cosmo-Rs.复合数据库ADFCRS-2010.

4.1:安装和使用COSMO-RS复合数据库

第1步:安装数据库

对于本教程,我们假设您知道ADFCR的启动程度如何。接下来,我们将安装ADFCRS-2010数据库。

adf.CR→化合物→安装COSMO-RS DATABSE ...
按照说明进行操作

对所有化合物的一些信息的下载和读数可能需要一分钟。更多信息此数据库可以在其中找到 Cosmo-Rs.手册. 您必须具备编写此数据库的权限($ home / .scm_gui / adfcrs-2010)。您可能需要具有管理员权限才能执行此操作。对于本教程,Cosmo-RS复合数据库必须在正确的目录中下载。

第2步:添加或搜索化合物

有几种方法可以从数据库中选择一个化合物并将其添加 添加的化合物列表。最简单的方法是使用搜索按钮。如果单击“搜索”按钮,将弹出单独的搜索窗口。在里面 添加的化合物列表 此搜索按钮看起来像:

../_images/t4_searchbutton2.png.

在其他窗口中,它看起来像: t4_searchbutton.png. (选择1个化合物)或 add.png. (添加多种化合物)。

选择化合物→添加的化合物列表
点击一下search button
../_images/t4_selectCompound.png.
点击‘CAS’按CAS注册表号排序
再次单击以反转订单
点击‘Nr’ to sort by number
点击‘dNr’按数据库号排序
点击‘Name’ to sort by name
点击‘Formula’ to sort by formula
进入‘pentanol’ in the ‘Search’ field
点击‘Cyclopentanol’
点击‘OK’
../_images/t4_selectpentanol.png.

现在是环戊醇被添加到 添加的化合物列表。如果使用搜索按钮,则再次使用Cyclopentanol将有1号。

../_images/t4_selectpentanol2.png.

在Cosmo-RS数据库中,有一个名为‘all.compoundlist’,这是一个纯文本文件,其中在每行上给出了ADF Cosmo结果文件的文件名。人们可以制作不同的.compoundlist文件,其中包含一个只有各种化合物的文件。如果想要向该化合物添加化合物,这可能是方便的 添加的化合物列表.

也可以通过选择通过添加多个.coskf文件来添加化合物‘COSMO kf file (*.coskf)’对于弹出菜单‘Files of type’ (or ‘Filter’),并选择所有.coskf文件。但是,在Windows上,可能会以这种方式一次添加超过几百个.coskf文件。如果失败,则应使用.compoundList文件。

第3步:设置纯复合数据

对于该数据库中的化合物,提供环原子(nring)的数量,在COSMO-RS模型中需要(参见 参考[2]在COSMO-RS手册中)为了计算环形校正项。

选择后 化合物→添加的化合物列表 并选择化合物也可以添加一些纯复合输入数据。例如,可以在参考文献中找到纯复合数据。 [411-413]。如果想要将纯复合输入数据保存在.coskf文件中选择 化合物→保存数据选择的化合物如.

第4步:可视化cosmo surface:adfview

您可以使用ADFView查看COSMO表面以及COSMO表面电荷密度。在这里,我们使用前一步的所选环戊醇。

选择化合物→添加的化合物列表
点击一下left side ‘Cyclopentanol’
选择化合物→显示所选化合物
选择the ADFView window ‘Cyclopentanol’
选择adf.VIEW→添加→COSMO:表面电荷密度→在COSMO表面上(重建)
选择adf.VIEW→添加→COSMO:表面电荷密度→在COSMO STAFE点
选择adf.VIEW→查看→背景→白色
增加ADFView窗口的大小,
这样ADFVIEW窗口底部的控制线都是可见的
在控制线中单击“‘Cosmo surface’ pull-down menu
并使用show详细信息命令
选择in the lowest line Colormap→彩虹
在控制线中单击“‘Cosmo surface’ pull-down menu
并使用隐藏详细信息命令
对此做同样的事情‘Cosmo surface points’
../_images/t4_pentanolcosmosurface.png.

接下来我们将关闭此ADFView窗口:

选择the ADFView window ‘Cyclopentanol’
选择adf.VIEW→文件→关闭
选择the COSMO-RS GUI window

4.2:辛醇 - 水分区系数(log pow )

在该实施例中,计算和与实验相比计算7种不同化合物的辛醇 - 水分配系数。

在部分可混溶的液体的情况下,如辛醇和水的辛醇相,两种组分都具有非零摩尔级分。接下来,输入值用于两种溶剂的卷商。富含辛醇的相中非零摩尔级分的值和两种溶剂的摩尔体积商均取自参考。 [421]。如果一个不包含这样的值,则程序将使用COSMO卷来计算卷额定报。通过选择化合物可以找到COSMO卷 添加的化合物列表.

选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Octanol-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’ button to add ‘Acetamide’, ‘Methanol’, ‘Formic acid’, ‘Diethyl ether’,
p-二氯苯., ‘Hexamethylbenzene’, and ‘2,2’,4,4’,5-五氯二苯苯基’
按‘Run’
进入the name ‘tutorial4’ in the ‘Filename’ field
../_images/t4_logpowinput.png

计算结果(可能需要几秒钟)以表的形式给出。请注意,并非所有化合物都被选为溶质,否则计算需要更多时间。

../_images/t4_logpow.png.

在数据库中名称‘Ethoxyethane’ is used for ‘Diethyl ether’, and the name ‘1,4-Dichlorobenzene’ is used for ‘p-Dichlorobenzene’。在弹出搜索按钮的搜索窗口中,如果单击搜索按钮,则给出一些替代名称的一些化合物。

接下来,将计算的辛醇 - 水分配系数与下表中的实验进行比较。

  sol 实验 计算
    \(log p_ {y} \) [422] \(log p_ {y} \)
1 乙酰胺 -1.16 -1.20
2 甲醇 -0.82 -0.53
3 甲酸 -0.41 -0.26
4 乙醚 0.83 1.82
5 p-二氯苯. 3.37 3.20
6 六甲基苯 4.61 4.96
7 2,2’,4,4’,5-五氯二苯苯基 6.41 6.47

参考

  1. 英石。林和S.I. Sandler,使用组贡献求解模型预测Octanol-Partition系数, 工业的&工程化学研究38(1999),4081
  1. 2010年7月15日从维基百科采取的实验号码, http://en.wikipedia.org/wiki/Partition_coefficient。实验编号可能已经在比25℃的不同温度下确定。

4.3:亨利’s law constants

在这个例子中亨利’计算17种不同化合物的法律常数,并与实验进行比较。

亨利’S法常数取决于溶剂的密度,在这种情况下水。如果在输入中不提供溶剂的密度,则程序通过将分子的质量与其COSMO体积分子除以溶剂来计算溶剂的密度。 20°C(293.15k)的水密度约为0.998kg / l。注意,计算的活动系数不依赖于水的密度。

备注:只要添加此示例中所需的化合物,也可以打开一个新的Cosmo-RS GUI窗口(SCM→COSMO-RS), 选择 化合物→添加化合物,转到下载COSMO-RS复合数据库的目录($ HOME / .scm_gui / adfcrs-2010),然后选择tutorial4.3.compoundlist。 这是建议的。然后,如果使用该列表的附加的化合物位于列表的顶部‘+’按钮或搜索按钮。 tutorial4.3.compoundlist是一个文件,其中包含有限于该示例所需的化合物的文件。

选择属性→活动系数
选择‘Water’对于溶剂中的第一组分
进入‘293.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
单击复选框‘使用输入密度溶剂(kg / l)’
进入‘0.998’ in the ‘使用输入密度溶剂(kg / l)’ field
检查‘+’ button to add
‘Acetaldehyde’, ‘Acetone’, ‘Acetonitrile’, ‘Benzene’, ‘Chloromethane’,
‘Cyclopentane’, ‘Dimethyl sulfide’, ‘Ethanol’, ‘Formaldehyde’,
‘Methanol’, ‘Methyl acetate’, ‘Methyl bromide’, ‘Methyl fluoride’,
‘Methyl iodide’, ‘Pyridine’, ‘Thiophene’, and ‘Toluene’
按‘Run’
../_images/t4_inputhenry.png

计算的结果(可能需要几秒钟,取决于所选择的化合物的数量)以表的形式给出。

../_images/t4_henrylaw.png

亨利’S法常数还取决于气相中纯化合物的蒸气压。在化合物窗口中,还可以在给定温度下设定纯化合物的这些蒸汽压力,或者设定抗菌参数。如果未指定这些值(如果它们为零),则使用COSMO-RS方法近似纯化合物蒸气压。最好的是在使用温度下包括纯化合物的实验蒸气压,因此在这种情况下为293.15k。

包括所有实验数字相当乏味,因此可以跳过以下部分,只看下面的结果。

选择化合物→添加的化合物列表
点击一下left side ‘Acetaldehyde’
进入‘0.968’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Acetone’
进入‘0.246’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Acetonitrile’
进入‘0.095’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Benzene’
进入‘0.100’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Chloromethane’
进入‘4.94’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Cyclopentane’
进入‘0.346’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Dimethyl sulfide’
进入‘0.530’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Ethanol’
进入‘0.059’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Formaldehyde’
进入‘4.47’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Methanol’
进入‘0.129’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Methyl acetate’
进入‘0.230’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Methyl bromide’
进入‘1.83’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Methyl fluoride’
进入‘33.7’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Methyl iodide’
进入‘0.443’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Pyridine’
进入‘0.021’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Thiophene’
进入‘0.082’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Toluene’
进入‘0.029’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Water’
进入‘0.02536’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘293.15’ in the ‘at temperature:’ field
选择属性→活动系数
按‘Run’

对于一些化合物来说是亨利’S法律常数差异很大。

../_images/t4_henrylaw_epp.png.

实验确定的亨利’例如,S法常数可能会被发现 http://www.henrys-law.org,其中A.‘compilation of Henry’关于环境化学潜在重要性的无机和有机物种的法律常数’被r.sander列出,也可以在亨利的许多不同定义和单位中找到解释’s law constants.

计算的亨利’S法常数将与下图和表中的实验值进行比较。实验数量取自参考文献。 [431],实验确定的无量纲亨利’s law constant HCC. 是无量纲亨利的倒数’s law constant kH CC. ,用于Cosmo-RS模块。

HCC. = kH,Inv. CC. = 1/(kH CC. )

../_images/t4_henrylaw_eppgraph.png.
  sol 实验 计算
    HCC. @20°C [431] HCC. @20°
1 甲基族 2.01 10.-1 2.05 10.-1
2 氯甲烷 3.05 10.-1 3.80 10.-1
3 甲基氟化物 6.04 10.-1 9.86 10.-1
4 甲基碘 1.70 10.-1 1.04 10.-1
5 环戊烷 5.25 10.0 3.27 10.0
6 1.91 10.-1 1.65 10.-1
7 甲苯 2.09 10.-1 1.89 10.-1
8 甲醇 1.37 10.-4 2.43 10.-4
9 乙醇 1.48 10.-4 3.70 10.-4
10 甲醛 8.61 10.-6 2.22 10.-2
11 乙醛 2.21 10.-3 3.72 10.-3
12 acetrone. 1.10 10.-3 0.78 10.-3
13 甲基_乙酸盐 4.02 10.-3 4.89 10.-3
14 乙腈 6.35 10.-4 6.35 10.-4
15 吡啶. 1.14 10.-2 2.03 10.-4
16 Dimethyl_Sulfide. 6.35 10.-2 1.82 10.-1
17 噻吩 7.46 10.-2 6.23 10.-2

在大多数情况下,计算的亨利’除甲醛和吡啶外,S法常数非常接近实验组。

亨利’甲醛的法律常数超过10倍3 错误的。该误差的起源是在水溶液中,甲醛的水合导致甲二醇,如果溶解甲醛在水中溶解甲醛,甲醇均匀。计算中没有考虑到这一点。在ref。 [432]在明显和内在的亨利之间进行区分’S法常数,彼此不同大约10分3 对于甲醛的甲醛,对乙醛约2.4倍。在ref。 [432]内在的亨利’甲醛的S法常数在25℃下测定为2.5mol /(latm),虽然在20的不同温度下°C。

计算的亨利’吡啶的法律常数约为102 与实验价值不同。 [431]。然而,从REF中获取吡啶的实验值。[433]是1.1 102 mol /(latm)和9.0 101 mol /(latm)与计算值与Cosmo-rs为2.1 10的计算值并不差2 mol /(latm)。此外,吡啶的实验值在REF中报道。 [434]与COSMO-RS计算的价值更好。

参考

  1. J. Staudinger和P.V.罗伯茨,亨利的关键汇编’S稀溶液中有机化合物的法律恒温关系, ChemoSphers 44(2001),561
  1. E.A.亨利·霍夫曼·霍夫曼’一些环境重要醛的法律常数, 环境科学&技术22(1988),1415
  1. R. Sander(1999),亨利的汇编’对环境化学潜在重要性的无机和有机物种的法律常数(版本3), http://www.henrys-law.org
  1. M.bernauera和V. Dohnal,限制活动系数和亨利的温度依赖性’用于N-甲基吡咯烷酮,吡啶和水中哌啶的法律常数, 流体相平衡282(2009),100

4.4:香草蛋白在有机溶剂中的溶解度

在该实施例中,试用5种不同溶剂中的香草素溶解度与实验相比。

香草蛋白(4-羟基-3-甲氧基苯甲醛)是室温下的固体。对于固体的溶解度,一个应包括熔点和固体熔化的焓焓 添加的化合物列表 对于选定的化合物。如果已知频繁融合的Δ热量也应包括在内,但通常不太重要。

备注:只要添加此示例中所需的化合物,也可以打开一个新的Cosmo-RS GUI窗口(SCM→COSMO-RS), 选择 化合物→添加化合物,转到下载COSMO-RS复合数据库的目录($ HOME / .SCM_GUI / ADFCRS-2010),然后选择TUTIRD4.4.compoundList。然后,如果使用该列表的附加的化合物位于列表的顶部‘+’按钮或搜索按钮。 tutorial4.4.compoundlist是一个文件,其中包含有限于该示例所需的化合物的文件。

选择化合物→添加的化合物列表
点击一下‘在化合物列表中搜索或添加化合物’
将弹出一个搜索窗口
进入‘Vanillin’ in the ‘Search’ field
点击‘Vanillin’
点击‘OK’
搜索窗口将消失
点击一下left side ‘Vanillin’
进入‘355’ in the ‘Melting point:’ field
进入‘5.35’ in the ‘Δ_fusion H:’ field
选择性质→纯溶剂中的溶解度
检查‘+’按钮添加纯复合溶剂
‘Water’, ‘1,2-Dichloroethane’
‘1-Propanol’, ‘Oxolane’ (THF), ‘Acetonitrile’,
‘2-Butanone’, ‘Ethanol’, ‘Methanol’, and ‘Toluene’
进入‘298.15’没有引用的温度‘from:’ field in ‘Kelvin’
进入‘298.15’ in the ‘to:’ field in ‘Kelvin’
选择‘Vanillin’ for the ‘Solute’
更改旋转旁边的弹出菜单‘Liquid’ to ‘Solid’
按‘Run’
../_images/t4_solubility_vanillin_water.png.

注意,为了计算摩尔/ L和G / L单位的溶解度,该程序使用溶剂和溶质的质量和宇宙体积的信息。特别是COSMO体积可能并不总是准确。

这些结果可以放在桌子中。与实验相比,很容易成为2个偏差。

  溶剂 实验溶解性香草素 计算溶解度香草素
    (mol / l)[441] (mol / l溶液)
1 1,2-二氯乙烷 1.175 2.65
2 1-丙醇 1.820 3.12
3 oxolane. 3.594 4.73
4 乙腈 2.360 3.30
5 2-丁酮 2.138 4.10
6 乙醇 2.470 3.56
7 甲醇 4.160 4.04
8 甲苯 0.302 0.99
9 0.070 0.034

参考

441.在2010年7月15日拍摄了一些有机溶剂中香草蛋白的实验确定的溶解度。见 the 开放笔记本科学挑战:有机化合物在有机溶剂中的溶解度,自然前翅, http://dx.doi.org/10.1038/npre.2010.4243.3, and http://onsbooks.wikispaces.com/ONS+Solubility+Challenge.

4.5:甲醇和己烷的二元混合物

在该实施例中,计算并将甲醇和己烷的蒸气液图与实验进行比较。

首先,甲醇和己烷的二元混合物在333.15kelvin的恒定温度下计算。接下来,该二元混合物在1.01325巴的恒定压力下计算。使用实验纯化合物。

选择化合物→添加的化合物列表
添加‘Methanol’ and ‘Hexane’ to this list
点击一下left side ‘Methanol’
进入‘0.845’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘333.15’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Hexane’
进入‘0.77’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘333.15’ in the ‘at temperature:’ field
选择属性→二元混合物VLE / LLE
选择‘Methanol’对于第一种化合物
选择‘Hexane’对于第二种化合物
进入‘100’ in the ‘Number of mixtures’ field
选择等温线,Isobar,闪点→等温线
进入‘333.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
按‘Run’
选择图→x轴→x1,y1
选择图→Y轴→总蒸汽压力
../_images/t4_hexane_methanol_333_15.png

在混溶性间隙的情况下,有两个摩尔分数x1和x1’,两种化合物都具有相同的活动。在计算中,可以绘制活动A1与A2。如果有闭环,则存在混溶性差距:

选择图→X轴→A1:X1 *伽玛
选择图→Y轴→活动
../_images/t4_hexane_methanol_activities.png.

因此,有一个计算的混乱间隙。表中给出了两个不混溶的液相的性质:计算的混溶性间隙在约x1 = 0.275和x1之间’= 0.811,计算出约1.48巴的总蒸气压。在混溶性间隙内,液体混合物由2个不混溶的液相组成,一种是富含甲醇的,其它己烷富含。但请注意,在混溶性间隙内,COSMO-RS计算进一步错误地使用强制的1液相而不是2个不混溶的液相。另请注意,压力最大的共沸物处于混溶性间隙中。

如果复选框 图→X轴→在可能的混溶性间隙中强制1液相 选择,然后将在混溶性差距内显示结果,其中两个液体被迫混合的不受神经条件。如果复选框 图→X轴→在可能的混溶性间隙中强制1液相 将取消选择,然后结果将在图中示出,仅针对这些混合物的组合物,其在混合物间隙之外。

../_images/t4_miscgap_deselect.png.
取消选中复选框
Graph → X Axes → 在可能的混溶性间隙中强制1液相
选择图→X轴→X1:摩尔分数1
选择图→Y轴→多余能量
../_images/t4_hexane_methanol_excess.png.
选择化合物→添加的化合物列表
点击一下left side ‘Methanol’
进入‘1.01325’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘337.8’ in the ‘at temperature:’ field
点击一下left side ‘Hexane’
进入‘1.01325’ in the ‘纯复合蒸气压:’ field
进入‘342’ in the ‘at temperature:’ field
选择属性→二元混合物VLE / LLE
选择‘Methanol’对于第一种化合物
选择‘Hexane’对于第二种化合物
进入‘100’ in the ‘Number of mixtures’ field
选择等温线,ISOBAR,闪点→ISOBAR
进入‘1.01325’ for the ‘Pressure’ in ‘bar’
按‘Run’
选择图→x轴→x1,y1
选择图→Y轴→温度
选择the check box
Graph → X Axes → 在可能的混溶性间隙中强制1液相

在大致x1 = 0.221和x1之间有一个计算的混溶性差距’= 0.835,计算温度约为323.3 kelvin(50.1°C)。在混溶性间隙内,液体混合物由2个不混溶的液相组成,一种是富含甲醇的,其它己烷富含。请注意,如果复选框‘在可能的混溶性间隙中强制1液相’选择,在混溶性间隙内,COSMO-RS计算进一步错误地使用强制1液相而不是2个不混溶的液相。另请注意,温度最小的共沸物处于混溶性差距。

../_images/t4_hexane_methanol_1_01325.png

取出甲醇 - 己烷混合物的实验结果。 [451]。这些与下图中的计算值进行比较。还可以在REF中找到更多的实验VLE数据。 [452]。

../_images/t4_binmix_epp.png.

4.6:水中大无限稀释活动系数

在该实施例中,计算并与实验相比,计算31种有机化合物中的无限稀释活性系数。

备注:只要添加此示例中所需的化合物,也可以打开一个新的Cosmo-RS GUI窗口(SCM→COSMO-RS), 选择 化合物→添加化合物,转到下载Cosmo-RS复合数据库的目录($ home / .scm_gui / adfcrs-2010),然后选择tutorial4.6.compoundlist。这是建议的。然后,如果使用该列表的附加的化合物位于列表的顶部‘+’按钮或搜索按钮。 tutorial4.6.compoundlist是一个文件,其中包含有限于该示例所需的化合物的文件。

选择属性→活动系数
选择‘Water’对于溶剂中的第一组分
检查‘+’按钮添加无限稀释溶质:
‘1,1,1-三氯乙烷’, ‘1,2-Dichloroethane’, ‘1-Bromobutane’, ‘1-Bromopropane’,
‘1-Chlorobutane’, ‘1-Chlorohexane’, ‘1-Chloropentane’, ‘1-Chloropropane’,
‘1-Propoxypropane’, ‘2-Bromobutane’, ‘2-Bromopropane’, ‘2-Chloropropane’,
‘Benzene’, ‘Bromoethane’, ‘Chloroform’, ‘Cumene’, ‘Dichloromethane’,
‘Diisopropyl_ether’, ‘Di-n-butyl_ether’, ‘Ethylbenzene’, ‘Ethyl_iodide’,
‘Mesitylene’, ‘m-Xylene’, ‘n-Butylbenzene’, ‘n-Propylbenzene’, ‘n-Propyl_iodide’,
‘o-Xylene’, ‘p-Xylene’, ‘Tetrachloroethene’, ‘Toluene’, and ‘Trichloroethene’,
按‘Run’
../_images/t4_largeact.png

这些结果可以放在图形和表格中。实验结果取自裁判。 [461]。

../_images/t4_largeactgraph.png.

这里’s the table

  sol 实验 计算
    \(\ gamma_2 ^ \ infty \) [461] \(\ gamma_2 ^ \ infty \)
1 二氯甲烷 253 278
2 二异丙基醚 628 2343
3 1,2-二氯乙烷 641 976
4 溴乙烷 679 601
5 氯仿 903 1474
6 2-氯丙烷 1.48 10.3 1.42 10.3
7 1-氯丙烷 1.75 10.3 1.73 10.3
8 2-溴丙烷 2.09 10.3 1.77 10.3
9 ethyl_iodide. 2.19 10.3 1.19 10.3
10 1-丙氧基丙烷 2.31 10.3 4.89 10.3
11 2.48 10.3 2.07 10.3
12 1-溴丙烷 2.86 10.3 2.36 10.3
13 1,1,1-三氯乙烷 5.90 10.3 5.77 10.3
14 1-氯丁烷 7.61 10.3 7.25 10.3
15 2-溴丁烷 8.32 10.3 7.81 10.3
16 n-propyl_iodide. 8.55 10.3 5.16 10.3
17 三氯乙烯 8.75 10.3 6.45 10.3
18 甲苯 9.19 10.3 8.14 10.3
19 1-溴丁烷 1.22 10.4 0.93 10.4
20 o-二甲苯 3.05 10.4 2.37 10.4
21 1-氯戊烷 3.21 10.4 3.13 10.4
22 乙苯. 3.27 10.4 3.00 10.4
23 M-二甲苯 3.32 10.4 3.56 10.4
24 P-二甲苯 3.33 10.4 3.30 10.4
25 四氯乙烯 3.60 10.4 3.81 10.4
26 Di-n-Butyl_ther 4.72 10.4 8.95 10.4
27 umbene. 1.02 10.5 0.83 10.5
28 Mesitylene.. 1.17 10.5 1.49 10.5
29 N-丙基苯 1.36 10.5 1.24 10.5
30 1-氯己烷 1.41 10.5 1.46 10.5
31 正丁基苯. 5.66 10.5 5.16 10.5

参考

  1. J. Li,A.J.达拉斯,D.I. Eikens,P.W. Carr,D.L. Bergmann,M.J. Hait,C.A. Ectert,通过惰性气体汽提和气相色谱法测量水中的大型无限稀释活性系数。 分析化学65(1993),3212

4.7:ADF COSMO-RS的参数化:溶剂化能量,蒸汽压力,隔板系数

在ref。 [471] ADF COSMO-RS参数适用于来自Klamt等人的补充材料的217个化合物的642个实验值。 [472]。这些性质是辛醇/水,己烷/水,苯/水和乙氧基乙烷/水的水合,蒸气压和分配系数的ΔG。在该示例中,所有这些属性将计算为217个化合物的组化合物,结果将与Klamt收集的实验数据进行比较。等等。在ref。 [472]。

请注意,本节中的这些计算可能需要一段时间,因为众多化合物一次计算。

打开一个新的cosmo-rs gui窗口(SCM→COSMO-RS)。选择 化合物→添加化合物 转到下载COSMO-RS复合数据库的目录($ HOME / .SCM_GUI / ADFCRS-2010),然后选择TUTIONAL4.7.comPoundList。

ΔG水合

选择属性→活动系数
选择‘Water’对于溶剂中的第一组分
进入‘298.15’ for ‘Temperature Kelvin’
单击复选框‘使用输入密度溶剂(kg / l)’
进入‘0.997’ in the ‘使用输入密度溶剂(kg / l)’ field
检查‘+’按钮添加无限稀释溶质,从列表中的第一个217
按‘Run’
../_images/t4_dghydrinput.png

可以与实验值进行比较自由能量(δg(kcal / mol)气体→溶质)的结果,参见 这表 和next graph.

../_images/t4_dg_epp.png.

蒸汽压力

选择性质→蒸气压纯化合物
进入‘298.15’ for ‘Temperature Kelvin’
检查‘+’按钮从列表中添加第一个217
按‘Run’
../_images/t4_logpvapinput.png

一个应该拍摄日志10 在杆中计算的蒸气压。可以将计算的蒸汽压力的结果与实验值进行比较,参见 这表 和下图。建议是为了几个化合物来做这一点。

../_images/t4_vap_exp.png.

辛醇 - 水分配系数

选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Octanol-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’按钮将第一个217从列表中添加到无限稀释溶质列表中
按‘Run’
../_images/t4_logpowinput.png

可以将辛醇 - 水分配系数的结果与实验值进行比较,见 这表 和next graph.

../_images/t4_oW_exp.png.

己烷 - 水,苯 - 水和乙氧基乙烷 - 水分配系数

选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Hexane-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’按钮将第一个217从列表中添加到无限稀释溶质列表中
按‘Run’
../_images/t4_logphwinput.png
选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Benzene-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’按钮将第一个217从列表中添加到无限稀释溶质列表中
按‘Run’
../_images/t4_logpbwinput.png.
选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Ether-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’按钮将第一个217从列表中添加到无限稀释溶质列表中
按‘Run’
../_images/t4_logpewinput.png

可以将己烷 - 水,苯 - 水和乙氧基乙烷 - 水(醚水)分配系数的结果与实验值进行比较,参见 这表 和next graph.

../_images/t4_part_exp.png.

表:Cosmo-Rs的参数化

adf. Cosmo-RS参数适用于来自补充材料的217个化合物的642个性能的实验值 of Klamt et al. [472]。 这些性质是水合的ΔG,蒸气压(日志10 Pv,P.v in bar) and the log10 辛醇/水的分区系数(LOG P.ow ),己烷/水(Log P.h ),苯/水(Log P.BW. )和乙氧基乙烷/水(log pEW. ). 配合排除了水的性质。

下一个表显示ADF COSMO-RS实现的结果和该化合物 Cosmo-Rs.复合数据库ADFCRS-2010. 查看Cosmo-RS GUI教程 adf. COSMO-RS的参数化, 如何使用ADF Cosmo-RS程序计算这些值。

sol ΔG散发 日志P.ow 日志P.v
Exp。 Calc。 Exp。 Calc。 Exp。 Calc。
甲烷 1.97 1.55 1.09 0.89   2.45
乙烷 1.81 1.80 1.81 1.58   1.83
丙烷 1.97 1.96 2.28 2.14 0.98 1.30
丁烷 2.12 2.10 2.89 2.73 0.39 0.74
异丁烷 2.31 2.03 2.76 2.65 0.54 0.78
戊烷 2.33 2.24 3.39 3.31 -0.17 0.19
2-甲基丁烷 2.38 2.14   3.14 -0.04 0.31
2,2-二甲基丙烷 2.58 2.04 3.11 3.00 0.23 0.39
己烷 2.53 2.38 3.90 3.89 -0.70 -0.35
辛烷 2.89 2.64 4.90 5.05 -1.73 -1.45
环丙烷 0.75 0.60 1.72 1.58   0.93
环戊烷 1.20 1.09 3.00 2.85 -0.34 -0.13
甲基环戊烷 1.60 1.19 3.37 3.33 -0.74 -0.61
环己烷 1.23 1.05 3.44 3.29 -0.84 -0.67
cyclocon. 0.85 0.81 4.45 4.10   -1.75
乙烯 1.27 1.01 1.13 1.04   1.82
丙烯 1.27 1.11 1.77 1.63 1.06 1.24
1-丁烯 1.38 1.29 2.40 2.23 0.48 0.70
异丁烯 1.22 1.15 2.34 2.10 0.48 0.74
CIS-2-丁烯   1.27 2.31 2.20 0.33 0.72
1-戊烯 1.66 1.44   2.82 -0.07 0.16
2-甲基-2-丁烯 1.31 1.42   2.72 -0.21 0.26
1-Hexene. 1.68 1.55 3.39 3.35 -0.61 -0.35
1-octene. 2.17 1.83 4.57 4.52 -1.63 -1.44
环戊烯 0.56 0.45   2.39 -0.29 -0.08
环己烷 0.37 0.32 2.86 2.85 -0.93 -0.70
1-甲基环己烯 0.67 0.48   3.42 -1.41 -1.22
1,2- ProPadieNe.   0.57 1.45 1.27 0.77 1.19
1,3-丁二烯 0.59 0.68 1.99 1.84 0.45 0.64
异戊二烯. 0.68 0.80   2.33 -0.13 0.20
1,4-五等 0.94 0.85 2.48 2.38 0.01 0.17
乙炔 -0.01 -0.63 0.37 0.37   1.18
propyne. -0.31 -0.51 0.94 0.92 0.76 0.59
1-Butyne. -0.16 -0.24 1.45 1.58 0.28 0.16
2-Butyne.   -0.13 1.46 1.66 -0.03 0.17
1-Pentyne. 0.01 -0.07 1.98 2.17 -0.24 -0.33
1-Hexyne. 0.29 0.06 2.73 2.74 -0.77 -0.85
1-octyne. 0.71 0.34   3.91 -1.77 -1.89
1-Buten-3-yne 0.04 -0.27   1.43 0.32 0.33
甲醇 -5.09 -4.87 -0.77 -0.53 -0.78 -0.85
乙醇 -4.96 -4.70 -0.31 0.09 -1.10 -1.24
1-丙醇 -4.84 -4.53 0.25 0.62 -1.54 -1.61
2-丙醇 -4.76 -4.50 0.05 0.59 -1.20 -1.54
1-丁醇 -4.72 -4.52 0.88 1.20 -1.85 -2.17
2-丁醇 -4.59 -3.85 0.61 1.32 -1.61 -1.83
2-甲基-1-丙醇 -4.52 -3.94 0.76 1.28 -1.78 -1.86
2-甲基-2-丙醇 -4.51 -4.37 0.35 1.00 -1.44 -1.82
1-戊醇 -4.48 -4.32 1.56 1.82 -2.60 -2.65
1-庚醇 -4.24 -4.05 2.72 2.96 -3.62 -3.63
1-辛醇 -4.10 -3.92 2.97 3.55 -4.05 -4.15
2-propen-1-ol -5.03 -4.31 0.17 0.41 -1.43 -1.34
2-propyn-1-ol   -5.10 -0.38 0.14 -1.68 -1.78
环己醇 -5.47 -5.52 1.23 1.67 -3.12 -3.32
甲氧基甲烷 -1.89 -1.48 0.10 0.47 0.77 0.90
乙氧基乙烷 -1.69 -1.24 0.89 1.82 -0.14 -0.24
1-丙氧基丙烷 -1.15 -0.93 2.03 2.95 -1.08 -1.24
2-甲氧基丙烷 -1.66 -1.48 1.21 1.58 -0.22 -0.15
2-甲氧基-2-甲基丙烷 -2.21 -1.53 0.94 1.95 -0.47 -0.54
二甲氧基甲烷 -2.93 -3.22 0.18 0.55 -0.27 -0.64
1,2-二甲氧基乙烷 -4.83 -3.07 -0.21 1.10 -1.00 -0.94
氧化乙烷   -2.57 -0.30 0.02 0.24 0.23
2-甲氧硅烷   -2.78 0.03 0.49 -0.14 -0.27
2-乙氧基甲烷 -2.91 -2.64   1.05 -0.50 -0.73
oxolane. -3.47 -3.36 0.46 0.97 -0.67 -0.67
四氢-2h-pyran -3.12 -2.93 0.95 1.51 -1.02 -1.06
1,3-二氧戊烷 -4.10 -4.21 -0.37 0.03 -0.86 -0.92
1,4-二恶烷 -5.05 -5.40 -0.42 0.14 -1.30 -1.61
甲醛   -2.07   -0.48 0.71 0.79
乙醛 -3.50 -3.29 -0.04 -0.31 0.08 -0.01
丙语 -3.44 -2.98 0.59 0.31 -0.37 -0.30
丁塔尔 -3.18 -2.85 0.88 0.85 -0.83 -0.74
2-甲基丙甘肉 -2.90 -2.63   0.90 -0.64 -0.63
-2.81 -2.59 1.78 2.01 -1.83 -1.74
辛烷值 -2.29 -2.32   3.14 -2.80 -2.75
2-propenal. -3.10 -3.53 -0.01 0.00 -0.44 -0.57
丙酮 -3.85 -4.30 -0.24 -0.12 -0.49 -0.68
2-丁酮 -3.67 -3.75 0.29 0.59 -0.95 -0.98
2-浮野 -3.53 -3.62 0.91 1.14 -1.33 -1.42
3-戊尼 -3.41 -3.22 0.80 1.34 -1.33 -1.33
3-甲基-2-丁酮 -3.24 -3.46 0.56 1.11 -1.16 -1.29
2-庚酮 -3.04 -3.37 1.98 2.30 -2.30 -2.44
2-odanone. -2.88 -3.26 2.37 2.87 -2.77 -2.96
环己酮 -4.60 -5.38 0.81 1.02 -2.21 -2.41
2,3-丁丹契埃   -3.52   0.44 -1.11 -1.30
p-苯醌   -6.12 0.20 0.27   -3.16
acetic_acid. -6.70 -6.20 -0.17 -0.02 -1.67 -2.08
propanoic_acid. -6.47 -5.73 0.33 0.61 -2.26 -2.24
丁腾·萨奇德 -6.35 -5.59 0.79 1.16 -2.98 -2.67
methyl_formate. -2.78 -2.73   0.00 -0.11 -0.19
ethyl_formate. -2.65 -2.75 0.23 0.57 -0.49 -0.65
甲基_乙酸盐 -3.31 -3.21 0.18 0.39 -0.54 -0.69
乙酸乙酯 -3.09 -3.28 0.73 0.95 -0.90 -1.21
Propyl_Acetate. -2.86 -3.10 1.24 1.56 -1.36 -1.69
ethyl_propanoate. -2.80 -2.85 1.21 1.63 -1.30 -1.57
二甲基丙基丙酯   -3.19   0.67 -1.15 -1.22
二乙基碳酸酯   -3.29 1.21 1.75 -1.84 -2.23
-0.87 -0.83 2.13 2.12 -0.90 -0.79
甲苯 -0.82 -0.77 2.73 2.67 -1.42 -1.34
o-二甲苯 -0.90 -0.79 3.12 3.09 -2.05 -1.82
M-二甲苯 -0.82 -0.66 3.20 3.26 -1.96 -1.90
P-二甲苯 -0.81 -0.64 3.15 3.23 -1.93 -1.85
乙苯. -0.70 -0.62   3.19 -1.90 -1.80
叔丁基苯. -0.44 -0.56 4.11 3.89 -2.52 -2.53
联苯 -2.64 -2.81 4.01 3.86   -4.21
二苯基甲烷 -2.81 -2.86 4.14 4.30   -4.75
萘甲苯. -2.40 -2.17 3.30 3.19   -2.97
蒽. -3.46 -3.47 4.45 4.25   -5.09
苯乙烯 -1.27 -1.19 2.95 2.80 -2.02 -1.84
苯酚 -6.57 -5.82 1.46 1.72   -2.86
2-甲基苯酚 -5.87 -5.40 1.95 2.30   -3.12
4-甲基苯酚 -6.13 -5.67 1.94 2.21   -3.39
4-叔丁基苯酚 -5.92 -5.45 3.31 3.43   -4.51
甲氧基苯 -2.55 -2.27 2.11 2.32 -2.32 -2.17
1-苯基乙酮 -4.58 -4.98 1.58 1.59 -3.25 -3.17
二苯基甲烷   -6.16 3.18 3.08   -5.70
苯甲醛 -4.02 -4.51 1.48 1.27 -3.00 -2.61
3-羟基苯甲醛 -9.51 -9.67 1.38 1.08   -5.73
4-羟基苯甲醛 -10.47 -10.58 1.35 0.95   -6.35
苯甲酸   -6.89 1.87 1.87   -4.13
甲基苯甲酸甲酯 -4.28 -3.89 2.12 2.26 -3.11 -3.23
呋喃 -0.90 -1.26 1.34 1.35 -0.10 -0.34
一氧化碳 2.23 1.56   0.92   2.41
二氧化碳 0.11 0.80   0.81 1.81 1.91
2.34 1.39   0.12   3.26
-6.29 -8.32 -1.38 -1.57 -1.50 -2.97
氢气氧化物   -8.48 -1.18 -0.57 -2.58 -2.28
2.45 2.32 0.67 0.88   3.02
  -5.05   -1.23 1.00 0.42
甲烷胺   -3.92   -0.22 0.55 0.59
N-甲基甲烷胺   -2.51   0.70 0.31 0.60
N,N-二甲基甲烷胺   -1.00   1.51 0.33 0.68
乙胺   -3.90   0.30 0.14 0.17
N-乙醇胺   -1.90   2.03 -0.52 -0.41
n,n-二乙乙醇胺   -0.34   3.35 -1.11 -0.96
1-丙胺   -3.55   1.00 -0.38 -0.30
2-丙胺   -3.43   1.00 -0.11 -0.27
1-丁胺胺   -3.44   1.57 -0.91 -0.79
2-甲基-2-丙胺   -3.47   1.36 -0.32 -0.60
1-戊烷胺   -3.29   2.16 -1.40 -1.29
1-六己胺   -3.38   2.63 -1.93 -1.79
N-丙基-1-丙胺   -1.80   3.12 -1.49 -1.40
正丁基-1-丁沙丹胺   -1.54   4.28 -2.47 -2.45
阿齐西丁   -4.63   -0.13 -0.50 -0.35
吡咯烷   -3.40   1.42 -1.08 -0.73
哌啶   -3.22   1.94 -1.37 -1.24
1-甲基哌啶   -1.79   2.72   -1.23
哌嗪.   -7.44   0.65   -2.28
1,2-乙基二胺   -8.66   -0.66 -1.79 -1.93
甲酰胺   -10.92 -1.59 -1.56   -4.93
乙酰胺   -11.03 -1.26 -1.20   -5.04
N-甲基甲酰胺   -8.80 -0.97 -0.94 -3.15 -3.39
N-甲基乙酰胺 -10.08 -9.08 -1.05 -0.46 -3.85 -3.71
N,N-二甲基甲酰胺   -6.91 -1.01 -0.48 -2.36 -1.69
N,N-二甲基乙酰胺 -8.55 -7.22 -0.77 0.03 -3.12 -2.01
甲基_Carbamate.   -8.57 -0.66 -0.34   -3.94
苯胺 -5.68 -5.15 0.51 1.40 -3.05 -2.89
苯基甲烷胺   -4.42   1.92 -3.02 -2.68
吡咯. -4.30 -4.53 0.75 1.18 -1.96 -1.52
3-甲基-1H-吲哚 -5.91 -5.53 2.60 2.96   -3.90
1H-咪唑.   -11.39 -0.08 -0.45   -6.00
4-甲基-1H-咪唑 -10.24 -10.76 0.23 0.22   -5.99
吡啶. -4.70 -4.53 0.65 0.82 -1.56 -1.35
O-皮吡林 -4.63 -4.30 1.11 1.48 -1.82 -1.75
M-ic甲壶 -4.77 -4.71 1.20 1.34 -2.10 -1.87
P-ic甲盆 -4.93 -4.95 1.22 1.28 -2.12 -1.93
2,6-二甲基吡啶 -4.60 -3.96 1.68 2.16 -2.13 -2.21
喹啉. -5.69 -5.36 2.03 2.07 -4.10 -3.42
哒嗪   -8.69 -0.72 -0.66   -2.80
嘧啶.   -5.95 -0.40 -0.05   -1.56
吡嗪.   -5.30 -0.26 0.08   -1.33
2-甲基吡嗪 -5.52 -5.36 0.23 0.67   -1.78
氰化氢   -2.69 -0.25 -0.36 -0.01 0.10
乙腈 -3.89 -4.42 -0.34 -0.61 -0.93 -1.06
propanenitrile. -3.85 -4.03 0.16 0.06 -1.21 -1.17
丁尼腈 -3.64 -3.86 0.53 0.65 -1.59 -1.55
2-甲基丙二腈   -3.71 0.46 0.66 -1.37 -1.40
2-propenenitrile. -3.16 -3.11 0.25 0.24 -0.85 -0.79
苯腈 -3.64 -4.44 1.56 1.42 -2.96 -2.90
3-羟基苯甲酸盐 -9.66 -9.63 1.70 1.36   -5.70
4-羟基苯甲酸盐 -10.17 -10.42 1.60 1.19   -6.19
malontonitrile.   -6.29 -0.60 -0.47   -3.37
硝基甲烷 -4.02 -3.65 -0.35 -0.03 -1.32 -1.24
硝基乙烷 -3.71 -3.40 0.18 0.53 -1.55 -1.41
1-硝基丙烷 -3.34 -3.07 0.87 1.18 -1.87 -1.69
2-硝基丙烷 -3.14 -2.84   1.22 -1.64 -1.51
硝基苯 -4.12 -3.95 1.85 1.87 -3.52 -3.02
1-甲基-2-硝基苯 -3.59 -3.94 2.30 2.18 -3.61 -3.26
1-甲基-3-硝基苯 -3.45 -4.04 2.42 2.36 -3.56 -3.54
3-硝基苯酚 -9.63 -8.95 2.00 1.81   -5.27
4-硝基苯酚 -10.65 -10.34 1.91 1.60   -6.25
2-硝基苯腈   -7.48 1.02 1.22   -5.45
3-硝基苯腈   -6.47 1.17 1.35   -4.82
4-硝基苯腈   -6.18 1.19 1.41   -4.66
吗啉代   -6.53   0.34 -1.87 -2.04
4-甲基丙酮   -5.01   1.14   -1.76
氯甲烷 -0.55 -0.66 0.91 0.87 0.76 0.66
二氯甲烷 -1.18 -1.36 1.25 1.35 -0.24 -0.31
氯仿 -1.05 -1.03 1.97 2.15 -0.58 -0.79
四氯醌 0.10 -0.06 2.83 2.95 -0.82 -1.06
氯乙烷 -0.46 -0.54 1.43 1.46 0.20 0.12
1,1-二氯乙烷 -0.86 -1.23 1.79 1.89 -0.52 -0.84
六氯乙烷 -1.06 -0.71 4.14 3.96   -2.65
1-氯丙烷 -0.35 -0.34 2.04 2.05 -0.34 -0.36
2-氯丙烷 -0.25 -0.47 1.90 1.96 -0.16 -0.37
1-氯丁烷 -0.14 -0.21 2.64 2.62 -0.86 -0.89
1-氯戊烷 -0.07 -0.07   3.21 -1.36 -1.41
2-氯戊烷 0.07 -0.04   3.10 -1.17 -1.28
1,1-二氯乙烯 -0.22 0.04 2.13 2.18 -0.10 -0.11
CIS-1,2-二氯乙烯 -1.17 -0.85 1.86 1.88 -0.57 -0.44
Trans-1,2-二氯乙烯 -0.76 -0.30 2.09 2.03 -0.35 -0.17
三氯乙烯 -0.50 -0.24 2.42 2.69 -1.00 -0.86
四氯乙烯 -0.16 0.05 3.40 3.33 -1.62 -1.41
氯苯 -1.12 -1.44 2.89 2.65 -1.80 -1.78
1,2-二氯苯. -1.56 -1.86 3.43 3.16 -2.74 -2.62
1,3-二氯苯. -1.25 -1.66 3.53 3.26 -2.60 -2.56
1,4-二氯苯. -1.38 -1.78 3.44 3.20 -2.63 -2.59
六氯苯. -1.78 -1.95 5.31 5.16   -4.90
sol 日志P.h 日志P.BW. 日志P.EW.
Exp。 Calc。 Exp。 Calc。 Exp。 Calc。
甲烷   1.01   1.12   1.09
乙烷   1.79   1.85   1.84
丙烷 2.97 2.42   2.45   2.46
丁烷 3.62 3.08   3.08   3.10
异丁烷   2.98   3.00   3.02
戊烷 4.27 3.73 3.90 3.71   3.74
2-甲基丁烷   3.53   3.53   3.56
2,2-二甲基丙烷   3.37   3.40   3.41
己烷   4.37 4.48 4.32   4.37
辛烷   5.66   5.56   5.64
环丙烷   1.75   1.94   1.91
环戊烷   3.21   3.21   3.23
甲基环戊烷   3.75   3.73   3.76
环己烷 4.15 3.71 3.87 3.67   3.71
cyclocon.   4.61   4.54   4.60
乙烯   1.14   1.38   1.34
丙烯   1.80   2.02   1.98
1-丁烯   2.47   2.66   2.63
异丁烯   2.32   2.53   2.50
CIS-2-丁烯   2.44   2.62   2.59
1-戊烯   3.13   3.29   3.27
2-甲基-2-丁烯   3.02   3.17   3.16
1-Hexene.   3.72   3.86   3.85
1-octene.   5.03   5.12   5.14
环戊烯   2.66   2.80   2.79
环己烷   3.19   3.30   3.28
1-甲基环己烯   3.82   3.91   3.91
1,2- ProPadieNe.   1.32   1.67   1.68
1,3-丁二烯   1.98   2.29   2.28
异戊二烯.   2.54   2.82   2.80
1,4-五等   2.59   2.89   2.86
乙炔   0.08   0.66   0.89
propyne.   0.85   1.38   1.39
1-Butyne.   1.60   2.08   2.08
2-Butyne.   1.75   2.18   2.10
1-Pentyne.   2.27   2.71   2.72
1-Hexyne.   2.91   3.33   3.35
1-octyne.   4.22   4.58   4.62
1-Buten-3-yne   1.38   1.88   1.98
甲醇 -2.80 -2.80 -1.85 -2.05 -1.10 -0.50
乙醇 -2.10 -2.08 -1.23 -1.38 -0.55 0.04
1-丙醇 -1.50 -1.40 -0.94 -0.72 0.05 0.59
2-丙醇 -1.75 -1.39   -0.72 -0.23 0.50
1-丁醇 -0.75 -0.90 -0.26 -0.26 0.71 1.17
2-丁醇 -0.96 -0.41   0.17 0.50 1.42
2-甲基-1-丙醇 -0.82 -0.58 -0.12 0.01 0.71 1.45
2-甲基-2-丙醇 -1.16 -0.87   -0.23 0.21 0.87
1-戊醇 -0.26 -0.19 0.47 0.43 1.20 1.87
1-庚醇 1.20 1.11 1.91 1.67 2.40 3.13
1-辛醇   1.76   2.29 2.91 3.77
2-propen-1-ol   -1.49   -0.74 -0.12 0.61
2-propyn-1-ol   -2.02   -1.05   0.82
环己醇 0.14 -0.22   0.37 0.95 1.57
甲氧基甲烷   0.07   0.52   0.36
乙氧基乙烷 0.93 1.50   1.83 1.00 1.70
1-丙氧基丙烷   2.75   3.03   2.93
2-甲氧基丙烷   1.19   1.57   1.43
2-甲氧基-2-甲基丙烷   1.55   1.91   1.79
二甲氧基甲烷   0.08   0.75   0.55
1,2-二甲氧基乙烷   0.58   1.21   1.00
氧化乙烷   -0.32   0.27   0.13
2-甲氧硅烷   0.13   0.70   0.53
2-乙氧基甲烷   0.76   1.29   1.13
oxolane.   0.31   0.76   0.58
四氢-2h-pyran 0.94 1.05   1.44   1.28
1,3-二氧戊烷   -0.50   0.22   0.02
1,4-二恶烷   -0.68   0.10   -0.14
甲醛   -0.83   -0.16 -0.96 -0.25
乙醛   -0.82   -0.09 -0.48 -0.27
丙语   -0.12   0.54 0.30 0.36
丁塔尔   0.47   1.11   0.93
2-甲基丙甘肉 0.08 0.59   1.19   1.00
  1.77   2.35   2.19
辛烷值   3.03   3.56   3.43
2-propenal.   -0.52   0.24   0.11
丙酮 -0.93 -0.87 -0.04 -0.10 -0.21 -0.31
2-丁酮 -0.23 0.00 0.56 0.68   0.49
2-浮野 0.65 0.59   1.25   1.06
3-戊尼   0.89   1.48   1.30
3-甲基-2-丁酮   0.63   1.26   1.06
2-庚酮 1.70 1.89 2.43 2.49   2.33
2-odanone. 2.05 2.52   3.10   2.95
环己酮   0.36   1.03   0.78
2,3-丁丹契埃   0.07   0.96   0.80
p-苯醌 -0.39 -0.27   0.79 -0.50 0.65
acetic_acid. -3.15 -2.70   -1.74 -0.33 0.76
propanoic_acid. -2.05 -1.89   -1.00 0.22 1.42
丁腾·萨奇德 -1.45 -1.27   -0.41 0.68 1.99
methyl_formate.   -0.38   0.39   0.29
ethyl_formate.   0.25   0.97   0.84
甲基_乙酸盐 -0.19 -0.01 0.50 0.72 0.43 0.54
乙酸乙酯 0.34 0.58 1.05 1.27 0.93 1.07
Propyl_Acetate. 1.00 1.26 1.62 1.92   1.73
ethyl_propanoate.   1.38   2.01   1.82
二甲基丙基丙酯   0.40   1.20   1.04
二乙基碳酸酯   1.58   2.31   2.10
2.30 2.28   2.62   2.62
甲苯 2.90 2.90   3.22   3.21
o-二甲苯 3.25 3.37   3.68   3.67
M-二甲苯 3.30 3.57   3.85   3.84
P-二甲苯 3.25 3.54   3.82   3.81
乙苯. 2.90 3.49   3.78   3.77
叔丁基苯. 4.41 4.27   4.55   4.55
联苯 4.00 4.14   4.61   4.66
二苯基甲烷   4.63   5.12   5.15
萘甲苯. 3.39 3.42   3.83   3.88
蒽. 4.23 4.55   5.02   5.13
苯乙烯   2.99 3.48 3.40   3.44
苯酚 -0.88 -0.60 0.37 0.21 1.71 2.84
2-甲基苯酚 0.17 0.16 1.15 0.91   3.45
4-甲基苯酚 -0.20 0.06   0.84   3.33
4-叔丁基苯酚 1.20 1.48   2.22   4.66
甲氧基苯 2.11 2.40   2.93 2.46 2.90
1-苯基乙酮 1.16 1.17 2.20 1.92 1.75 1.81
二苯基甲烷 3.29 2.86   3.63   3.57
苯甲醛 1.14 0.92 2.10 1.66 1.74 1.57
3-羟基苯甲醛 -2.41 -2.08 -0.55 -0.88 1.16 2.10
4-羟基苯甲醛   -2.59   -1.35   1.80
苯甲酸 -0.72 -0.56   0.31 1.84 2.94
甲基苯甲酸甲酯 1.99 2.16   2.81   2.73
呋喃   1.34   1.82   1.87
一氧化碳   1.06   1.17   1.13
二氧化碳   0.85   1.14   1.12
  0.16   0.28   0.24
-4.34 -5.90 -3.37 -4.83 -1.77 -1.29
氢气氧化物   -5.43 -2.80 -4.33 -1.13 0.80
  1.01   1.10   1.07
  -3.76   -2.97   -2.53
甲烷胺   -2.29   -1.66   -1.52
N-甲基甲烷胺   -0.74   -0.27   -0.25
N,N-二甲基甲烷胺   0.76   1.07   0.95
乙胺   -1.75   -1.13   -1.02
N-乙醇胺   0.92   1.27   1.29
n,n-二乙乙醇胺   2.94   3.11   3.07
1-丙胺   -0.90   -0.35   -0.22
2-丙胺   -0.80   -0.26   -0.14
1-丁胺胺   -0.28   0.24   0.37
2-甲基-2-丙胺   -0.44   0.10   0.19
1-戊烷胺   0.38   0.88   1.02
1-六己胺   0.83   1.33   1.45
N-丙基-1-丙胺   2.02   2.33   2.36
正丁基-1-丁沙丹胺   3.31   3.58   3.62
阿齐西丁   -1.90   -1.21   -1.04
吡咯烷   -0.01   0.41   0.44
哌啶   0.74   1.10   1.13
1-甲基哌啶   2.15   2.36   2.28
哌嗪.   -2.17   -1.40   -1.28
1,2-乙基二胺   -4.49   -3.41   -3.01
甲酰胺   -5.76   -4.43 -2.85 -1.24
乙酰胺   -5.23   -3.95 -2.60 -1.42
N-甲基甲酰胺   -3.72   -2.61   -1.18
N-甲基乙酰胺   -3.37   -2.31   -1.10
N,N-二甲基甲酰胺 -2.71 -1.92   -0.99 -1.62 -1.27
N,N-二甲基乙酰胺 -1.42 -1.67   -0.78   -1.09
甲基_Carbamate.   -3.63   -2.49 -0.85 0.37
苯胺 -0.16 0.00 0.80 0.86 0.85 2.35
苯基甲烷胺   0.85   1.52   1.82
吡咯. -0.36 -0.51   0.32   2.31
3-甲基-1H-吲哚   1.44   2.20   4.29
1H-咪唑. -3.70 -4.95   -3.68   -0.97
4-甲基-1H-咪唑   -3.99   -2.81   -0.44
吡啶. -0.35 -0.25 0.45 0.39 0.08 0.29
O-皮吡林 0.31 0.45 0.93 1.03   0.93
M-ic甲壶 0.27 0.24 1.08 0.86   0.72
P-ic甲盆 0.21 0.09 1.03 0.73   0.59
2,6-二甲基吡啶 0.67 1.26 1.33 1.77   1.68
喹啉. 1.26 1.25   1.90   1.85
哒嗪   -2.61   -1.53   -1.70
嘧啶.   -1.44   -0.58   -0.72
吡嗪.   -1.12   -0.30   -0.43
2-甲基吡嗪   -0.52   0.24   0.07
氰化氢   -1.10 -0.54 -0.25 0.32 0.21
乙腈 -1.48 -1.20   -0.26 -0.22 -0.34
propanenitrile.   -0.39   0.46   0.29
丁尼腈   0.27   1.08   0.90
2-甲基丙二腈   0.31   1.08   0.88
2-propenenitrile.   -0.14   0.66   0.63
苯腈   1.17   1.96   1.90
3-羟基苯甲酸盐   -1.76   -0.55   2.57
4-羟基苯甲酸盐   -2.22   -0.94   2.37
malontonitrile.   -1.53   -0.09 0.04 0.48
硝基甲烷   -0.42   0.47   0.51
硝基乙烷   0.25   1.07   1.02
1-硝基丙烷   1.04   1.78   1.67
2-硝基丙烷   1.13   1.81   1.67
硝基苯   1.80   2.49   2.44
1-甲基-2-硝基苯   2.12   2.79   2.71
1-甲基-3-硝基苯   2.35   3.01   2.93
3-硝基苯酚   -1.33   -0.20   3.11
4-硝基苯酚   -1.81   -0.59   2.86
2-硝基苯腈   0.80   1.99   1.96
3-硝基苯腈   0.96   2.13   2.10
4-硝基苯腈   1.04   2.19   2.18
吗啉代   -1.42   -0.65   -0.65
4-甲基丙酮   0.04   0.65   0.42
氯甲烷   0.87   1.28   1.25
二氯甲烷   1.28   1.75   1.90
氯仿 1.65 2.19   2.51   2.73
四氯醌   3.28   3.36   3.42
氯乙烷   1.55   1.92   1.87
1,1-二氯乙烷   1.96   2.38   2.44
六氯乙烷   4.38   4.49   4.58
1-氯丙烷   2.22   2.55   2.51
2-氯丙烷   2.11   2.47   2.41
1-氯丁烷   2.86   3.17   3.13
1-氯戊烷   3.51   3.80   3.77
2-氯戊烷   3.41   3.68   3.65
1,1-二氯乙烯   2.36   2.56   2.64
CIS-1,2-二氯乙烯   1.92   2.28   2.43
Trans-1,2-二氯乙烯   2.10   2.42   2.56
三氯乙烯 2.86 2.90   3.09   3.22
四氯乙烯   3.71   3.77   3.82
氯苯 2.88 2.84   3.17   3.24
1,2-二氯苯. 3.47 3.40   3.70   3.80
1,3-二氯苯.   3.50   3.79   3.92
1,4-二氯苯.   3.41   3.73   3.87
六氯苯. 5.81 5.73   5.79   5.87

参考

  1. C.C. PYE,T.Ziegler,E. Van Lenthe,J.N. Louwen,在阿姆斯特丹密度官能包内的溶剂化溶剂化模型的实施。第二部分。 Cosmo真正的溶剂。 加拿大化学杂志87,790(2009)
  1. A.Klamt,V.Jonas,T.Bürger和J.C.Lohrenz,Cosmo-Rs的细化和参数化。 物理化学杂志102,5074(1998)

4.8:Cosmo-SAC 2013-ADF

在ref。 [481]在称为Cosmo-SAC 2013-ADF的方法中,参数优化与ADF Cosmo结果文件一起使用。在该示例中,将使用COSMO-SAC 2013-ADF计算分区系数,分配系数和二进制混合物,如在ADF中实现的,它可以与COSMO-SAC 2013-ADF的结果进行比较。[481]。 在化合物窗口中,一种可包括每个化合物,实验纯化合物液体密度(kg / l),程序可以从中计算纯复合液体摩尔体积。如果未给出这种密度,则纯化合物液体体积将由其COSMO体积计算。对于COSMO-SAC 2013-ADF这是重要的,因为混合物相互作用存在分散贡献,这取决于这些纯复合液体摩尔体积。

打开一个新的cosmo-rs gui窗口(SCM→COSMO-RS)。
选择方法→COSMO-SAC
../_images/t4_sacmethod.png.

这将使所有下一个计算都使用cosmo-sac 2013-adf方法而不是cosmo-rs

选择分析→Sigma型纯化合物
检查‘+’按钮添加苯胺,水,2-丁酮和丙酮
按‘Run’
选择图→Y轴→氢键(HB)部分Sigma曲线
../_images/t4_sacsigmainput.png

可以将SIGMA配置文件的结果与图3进行比较。参考文献3C和3F。 [481]。

../_images/t4_sacsigma.png ../_images/t4_sacsigmahb.png.
选择化合物→添加的化合物列表
添加‘Methanol’, ‘Ethanol’, ‘Acetone’, and ‘Pyridine’ to this list
(如果他们不在那里)
点击一下left side ‘Methanol’
进入‘0.7918’ in the ‘Density:’ field
点击一下left side ‘Ethanol’
进入‘0.789’ in the ‘Density:’ field
点击一下left side ‘Acetone’
进入‘0.791’ in the ‘Density:’ field
点击一下left side ‘Pyridine’
吡啶. ‘0.9819’ in the ‘Density:’ field
选择属性→日志分区系数
选择‘Preset Octanol-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
进入‘298.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
检查‘+’ button to add ‘Methanol’, ‘Ethanol’, ‘Acetone’, and ‘Pyridine’
按‘Run’
选择‘Preset Hexane-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
按‘Run’
选择‘Preset Benzene-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
按‘Run’
选择‘Preset Ether-Water’在溶剂旁边的弹出菜单中
按‘Run’

日志的结果10 辛醇/水的分区系数(LOG P.ow ),己烷/水(Log P.h ),苯/水(Log P.BW. )和乙氧基乙烷/水(log pEW. ),可以放在桌子里。这些结果可以与参考的支持信息的结果进行比较。 [481]。存在一些小的差异,但请注意,使用了不同的程序,因此实现的差异很小。

实验结果取自参考文献。 [471]。

sol 日志P.ow 日志P.h 日志P.BW. 日志P.EW.
Exp。 Calc。 Exp。 Calc。 Exp。 Calc。 Exp。 Calc。
甲醇 -0.77 -0.48 -2.80 -3.12 -1.85 -2.35 -1.10 -0.80
乙醇 -0.31 0.11 -2.10 -2.42 -1.23 -1.68 -0.55 -0.26
丙酮 -0.24 -0.17 -0.93 -0.85 -0.04 -0.12 -0.21 -0.20
吡啶. 0.65 0.86 -0.35 -0.10 0.45 0.85 0.08 0.51
选择化合物→添加的化合物列表
添加‘Acetone’ and ‘Water’ to this list
(如果他们不在那里)
点击一下left side ‘Acetone’
进入‘0.791’ in the ‘Density:’ field
进入‘3.7’ in the ‘纯复合蒸气压’ field
进入‘373.15’ in the ‘at temperature’ field
点击一下left side ‘Water’
进入‘0.997’ in the ‘Density:’ field
进入‘1.01325’ in the ‘纯复合蒸气压’ field
进入‘373.15’ in the ‘at temperature’ field
选择属性→二元混合物VLE / LLE
选择‘Acetone’对于第一种化合物
选择‘Water’对于第二种化合物
进入‘20’ in the ‘Number of mixtures’ field
选择等温线,Isobar,闪点→等温线
进入‘373.15’ for the ‘Temperature’ in ‘Kelvin’
按‘Run’
选择图→x轴→x1,y1
选择图→Y轴→总蒸汽压力
../_images/t4_sacbinmixinput.png.

将这些VLE结果与图4进行比较。参考图4F。 [481]。

../_images/t4_sacbinmix.png

参考

  1. R.Xiong,S.I. Sandler,R.I.Burnett,对COSMO-SAC的改进,用于预测热力学性质, Ind。Eng。化学。 res。 53,8265(2014)

由于COSMO-RS GUI教程的另一部分使用COSMO-RS方法,因此我们切换回COSMO-RS方法。

选择方法→COSMO-RS