设置

三键鼠标也非常方便使用ADF-GUI,并且在MAC上您可以使用魔术鼠标以实现此目的。要获得三个按钮(而不是标准一两个),请下载并安装一个免费的实用程序更好的特用机场或MagicPrefs,并将其配置为添加中间点击。

远程跑步

要使用带有远程计算机的ADFJOBS,您需要先设置SSH。您应该注意配置事物,以便访问远程计算机时无需键入密码。为此,您需要:

  • 创造 钥匙,
  • SSH代理人,
  • 将您的公钥添加到 授权_KEY. 在远程计算机上的文件。
  • 如果需要,请设置SSH配置文件。这允许您自动设置选项,如要在远程计算机上使用的用户名。

因此,用户(和adfjobs)应该能够使用ssh登录远程计算机,而无需输入密码。

如果您使用的是OpenSSH(通常在Linux机器或MacOSX上),可以通过将SCM_SSH_Multiplex环境变量设置为“是”(在GUI首选项模块中)来实现与远程计算机的通信更有效。

adfjobs不存储密码,它始终使用ssh命令与远程系统进行通信。

有关更多信息,请咨询您的SSH文档或互联网上的许多指南之一。

adfjobs队列

在ADFJOBS中定义正确的队列将使GUI更容易。例如,您可以在远程计算群集上轻松运行,您可以访问您的本地桌面上。 ADFJOBS将处理传输输入和输出文件等所有详细信息,您甚至可以监视运行作业的进度,就像它们在本地计算机上运行一样。

所以你应该花一些时间正确地设置队列。远程计算机上有预定义的队列。然后,您可以将ADFJOB配置为自动使用这些队列。您可以在稍后的情况下找到adfjobs队列的描述以及如何设置 本手册.

马皮克

马皮克(分子轨道包装)是基于杜瓦和泰尔的半经验量子化学计划’s nddo逼近。它可以从 OpenMopac.. The 马皮克的文件 也可以在该网站上提供。

adf.分布附带MOPAC。但是,需要在许可证文件中启用它。如果未启用,请联系SCM以获取更多信息。请注意,MOPAC为学术用户免费。 ADF分发所包含的MOPAC是OpenMopac的标准MoPAC,除了它使用SCM的许可证检查系统。它定期更新。

如果您希望使用与ADF分发附带的MOPAC版本不同,则可以通过在shell启动脚本或通过shell启动脚本中设置scm_mopac环境变量或通过 SCM→偏好 command:

  • 不要设置SCM_MOPAC当您想要运行ADF包中包含的MOPAC时,在大多数情况下,这是最简单的解决方案

  • 将SCM_MOPAC设置为MOPAC可执行文件的完整路径

  • 将SCM_MOPAC设置为某些命令(如果要在不同的计算机上运行MOPAC,则该命令必须通过参数和标准输入,并应在另一台机器(位于$ ADFHOME / BIN中)启动MOPAC.SCM脚本(例如:至使用名为mopac.domain.com的机器上的ADF分发附带的MOPAC,使用命令:

    export SCM_MOPAC="ssh mopac.domain.com adfhome/bin/mopac.scm"