参数文件

几个DFTB参数集用ADF包分发。可能需要额外的许可要求。请联系我们 执照@SCM..com 评估可用选项。

通常,参数文件是针对特定目的而设计的,可能与您的应用程序不同,因此可能不提供所需的精度。

请注意,来自不同参数集的参数文件可能不兼容。

可用参数集

德累斯顿

adf.包中可用的所谓的Dresden集DFTB参数文件是由J.F.Oliveier,N.Jardillier,T. Heine和G. Seifert设计的,主要在德国德累斯顿的Technische Universit,另见了一些 有关这些参数文件生成的其他信息。这些参数文件保存在$ adfhome / atomicdata / dftb / dresden中。

Quasinano.

Quasinano2013.1. ADF包中可用的DFTB参数文件集由Mohammad Wahiduzzaman等设计。包含定期表的大部分(无F元素)的参数。注意,QuasinAno2013.1集仅包含交互的电子部分,因此只能计算给定几何体的光谱,但没有总能量,因此也没有力。例如,这些参数可用于TDDFTB计算。

Quasinano2015 参数集扩展了Quasinano2013.1参数集,并包括计算总能量及其渐变所需的术语。

dftb.org.

SCM运送的DFTB实现提供了DFTB.org网站上可用的最新参数集。以下集目前已发货:

  • 3ob-3-1(br,c,ca,cl,f,h,i,k,mg,n,na,o,p,s,zn)
  • mio-0-1和mio-1-1(h,c,n,o,s,p):用于有机分子
  • PBC-0-3(SI,F,O,N,C,H,FE):用于固体和表面
  • Matsci-0-3(Al,Si,Cu,Na,Ti,Ba):用于材料科学的各种化合物

此外,将提供以下扩展集(版本0-1或1-1):

  • HYB-0-1(AG,GA,AS,SI)+ MIO-0-1:用于有机和无机混合系统
  • Chalc-0-1(AS,S)+ MIO-0-1:用于硫属化物玻璃
  • Miomod-HH-0-1 + MIO-1-1:包含用于H2的修改参数
  • Miomod-NH-0-1 + MIO-1-1:包含修改的参数设置FO N-H以改善N-H绑定能量
  • TiORG-0-1(Ti-(C,H,N,O,S,Ti))+ MiO-0-1:用于Ti Bulk,TiO2散装,TiO 2表面和TiO 2与有机分子
  • Trans3D-0-1(SC,Ti,Fe,Co,Ni))+ MiO-0-1:生物系统过渡金属元素
  • Znorg-0-1(Zn-(C,H,N,O,S,Zn))+ MiO-0-1:用于Zn散装,ZnO批量,ZnO表面和有机分子的ZnO

我们建议参观 dftb.org. 网站有关每个集合的更多详细信息。请注意,我们的DFTB的实现不支持包含F函数的参数集文件,例如“rare” set.

安装其他dftb.org参数文件

要在未来安装DFTB.ORG网站发布的新参数集,我们建议我们以下步骤

  • 使用命令tar-c $ adfreesources / dftb / dftb.org -xzvf newset-0-1.tar.gz,解压缩包含参数的tar.gz文件(例如,newset-0-1.tar.gz)。
  • 确保文件具有格式x-y.skf的名称,其中x和y元素符号(例如,c-c.skf,c-h.skf,al-h.skf)。如果不是这种情况,请重命名文件以遵循此命名。
  • 注意在打开包装的同时在$ ADFRESOUSE / DFTB / DFTB.ORG中创建的新目录名称(例如,Newset-0-1)

现在可以使用关键资源DIR指定新参数集

资源迪尔 DFTB..org/newset-0-1

三个订单参数文件

三阶评估的参数文件可根据单独的许可协议提供。有关更多信息,请联系我们的许可部门。三阶参数化使用分类的值“DFTB3 fit”在参考文献(Gaus,Cui和Elstner)。 DFTB3(Hubbard衍生品和Zeta)的特殊参数在文件中定义 metainfo.yaml. (see below).

metainfo.yaml.

应该有一个名为的文件 metainfo.yaml. 在每个资源目录中(见 资源迪尔), 例如 dftb.org/3ob-1-1/1/metainfo.yaml.。文件符合了 yaml. 语法约定。它包含DFTB计算所需的必要信息。具有解释评论的示例(以#开头)如下所示:

*# version info*
metainfo_version: 1

*# SCC models the current resources directory supports ("thirdorder" is aliased to "dftb3")
# possible models: noscc, scc, thirdorder*
supports: [ thirdorder ]

*# Hubbard derivatives for DFTB3, see DOI: 10.1021/ct300849w
# note: the list must be { } rather than [ ]*
Hubbard_derivatives:
    zeta: 4.000
    parameters: { H: -0.1857, C: -0.1492, N: -0.1535, O: -0.1575, P: -0.14, S: -0.11 }

*# magnetic Hubbard parameters for TD-DFTB, see DOI: 10.1103/PhysRevB.63.085108
# note: the list must be { } rather than [ ]*
magnetic_Hubbard:
    parameters: { H: -1.9700, C: -0.6180, N: -0.6940, O: -0.7590 }

*# London dispersion correction models*
dispersion:
*# default method to use if none is specified in the input script*
    default: D3-BJ
*# list of supported dispersion corrections*
    UFF:
    ULG:
    D2:
    D3-BJ:
*# D3-BJ dispersion parameters fitted by S. Grimme
# see: http://www.thch.uni-bonn.de/tc/index.php?section=downloadssubsection=DFT-D3*
        parameters: { s6: 1.0000, s8: 0.5883, a1: 0.5719, a2: 3.6017 }

*# references*
reference: |
    M. Gaus, A. Goez, M. Elstner
    "Parametrization and Benchmark of DFTB3 for Organic Molecules"
    J. Chem. 这ory Comput. 2013, 9 (1), pp 338-354.

    M. Gaus, X. Lu, M. Elstner, Q. Cui
    "Parameterization of DFTB3/3OB for Sulfur and
     Phosphorus for Chemical and Biological Applications"
    J. Chem. 这ory Comput. 2014, 10 (4), pp 1518-1537

*# references in short format*
short_reference: |
    [O-N-C-H] J. Chem. 这ory Comput. 2013, 9, 338-354.
    [P-S] J. Chem. 这ory Comput. 2014, 10, 1518-1537

*# web link*
url: http://www.dftb.org/parameters/download/3ob/3ob_2_1/

*# Slater-Koster files: "txtn" indicates encrypted, "txt" indicates unencrypted*
format: txtn